Le Pottok est originaire d'Amérique du Nord. Depuis des millénaires, ce cheval proche de celui de Prevalski a parcouru l'Alaska et la Sibérie pour s’installer en Asie puis migrer en Europe et disparaître en Amérique.
Installé dans les montagnes du Pays Basque, le Pottok s’est acclimaté suite aux dernières glaciations de la fin du quaternaire.
Des chevaux proches du Pottok ont été découverts dans les grottes de Sare, d'Oxocelhaya, d'Isturitz.
Leur morphologie a naturellement évolué pour s'adapter aux conditions écologiques et historiques.
Le Pottok est une race primitive locale des montagnes du Pays Basque.